Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SATB2Q9UPW6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SATB2Q9UPW6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SATB2Q9UPW6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SATB2Q9UPW6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SATB2Q9UPW6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SATB2Q9UPW6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SATB2Q9UPW6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SATB2Q9UPW6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SATB2Q9UPW6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SATB2Q9UPW6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SATB2Q9UPW6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SATB2Q9UPW6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SATB2Q9UPW6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SATB2Q9UPW6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SATB2Q9UPW6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SATB2Q9UPW6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SATB2Q9UPW6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SATB2Q9UPW6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SATB2Q9UPW6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SATB2Q9UPW6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SATB2Q9UPW6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SATB2Q9UPW6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms