Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRAK1Q9UPV9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRAK1Q9UPV9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
TRAK1Q9UPV9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
TRAK1Q9UPV9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
TRAK1Q9UPV9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRAK1Q9UPV9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRAK1Q9UPV9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRAK1Q9UPV9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRAK1Q9UPV9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRAK1Q9UPV9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRAK1Q9UPV9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
TRAK1Q9UPV9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
TRAK1Q9UPV9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TRAK1Q9UPV9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TRAK1Q9UPV9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRAK1Q9UPV9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
TRAK1Q9UPV9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36■■■■□ 3.35
TRAK1Q9UPV9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
TRAK1Q9UPV9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TRAK1Q9UPV9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRAK1Q9UPV9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRAK1Q9UPV9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRAK1Q9UPV9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRAK1Q9UPV9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRAK1Q9UPV9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRAK1Q9UPV9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRAK1Q9UPV9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRAK1Q9UPV9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRAK1Q9UPV9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRAK1Q9UPV9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TRAK1Q9UPV9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRAK1Q9UPV9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TRAK1Q9UPV9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
TRAK1Q9UPV9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRAK1Q9UPV9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRAK1Q9UPV9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRAK1Q9UPV9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TRAK1Q9UPV9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.34
TRAK1Q9UPV9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRAK1Q9UPV9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRAK1Q9UPV9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRAK1Q9UPV9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRAK1Q9UPV9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TRAK1Q9UPV9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRAK1Q9UPV9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRAK1Q9UPV9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRAK1Q9UPV9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRAK1Q9UPV9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRAK1Q9UPV9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRAK1Q9UPV9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRAK1Q9UPV9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
TRAK1Q9UPV9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TRAK1Q9UPV9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
TRAK1Q9UPV9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRAK1Q9UPV9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRAK1Q9UPV9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TRAK1Q9UPV9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TRAK1Q9UPV9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TRAK1Q9UPV9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TRAK1Q9UPV9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TRAK1Q9UPV9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
TRAK1Q9UPV9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TRAK1Q9UPV9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRAK1Q9UPV9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
TRAK1Q9UPV9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TRAK1Q9UPV9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
TRAK1Q9UPV9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRAK1Q9UPV9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRAK1Q9UPV9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRAK1Q9UPV9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRAK1Q9UPV9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TRAK1Q9UPV9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TRAK1Q9UPV9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
TRAK1Q9UPV9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRAK1Q9UPV9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TRAK1Q9UPV9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRAK1Q9UPV9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
TRAK1Q9UPV9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TRAK1Q9UPV9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRAK1Q9UPV9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TRAK1Q9UPV9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TRAK1Q9UPV9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TRAK1Q9UPV9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TRAK1Q9UPV9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRAK1Q9UPV9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TRAK1Q9UPV9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRAK1Q9UPV9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRAK1Q9UPV9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRAK1Q9UPV9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TRAK1Q9UPV9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRAK1Q9UPV9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRAK1Q9UPV9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TRAK1Q9UPV9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
TRAK1Q9UPV9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
TRAK1Q9UPV9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRAK1Q9UPV9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TRAK1Q9UPV9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRAK1Q9UPV9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TRAK1Q9UPV9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms