Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SAMD4AQ9UPU9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SAMD4AQ9UPU9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SAMD4AQ9UPU9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SAMD4AQ9UPU9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD4AQ9UPU9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD4AQ9UPU9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD4AQ9UPU9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD4AQ9UPU9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD4AQ9UPU9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SAMD4AQ9UPU9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMD4AQ9UPU9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMD4AQ9UPU9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMD4AQ9UPU9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SAMD4AQ9UPU9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMD4AQ9UPU9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMD4AQ9UPU9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMD4AQ9UPU9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMD4AQ9UPU9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMD4AQ9UPU9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAMD4AQ9UPU9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMD4AQ9UPU9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAMD4AQ9UPU9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAMD4AQ9UPU9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms