Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LHX6Q9UPM6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LHX6Q9UPM6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX6Q9UPM6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX6Q9UPM6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LHX6Q9UPM6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LHX6Q9UPM6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LHX6Q9UPM6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LHX6Q9UPM6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LHX6Q9UPM6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX6Q9UPM6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX6Q9UPM6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX6Q9UPM6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX6Q9UPM6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LHX6Q9UPM6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX6Q9UPM6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LHX6Q9UPM6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX6Q9UPM6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX6Q9UPM6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX6Q9UPM6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX6Q9UPM6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LHX6Q9UPM6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LHX6Q9UPM6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LHX6Q9UPM6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms