Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF490Q9ULM2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF490Q9ULM2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF490Q9ULM2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF490Q9ULM2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms