Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL8

SHROOM4, Protein Shroom4, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM4Q9ULL8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.94■■■■■ 5.43
SHROOM4Q9ULL8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.93■■■■■ 5.42
SHROOM4Q9ULL8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.93■■■■■ 5.42
SHROOM4Q9ULL8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.93■■■■■ 5.42
SHROOM4Q9ULL8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC48.93■■■■■ 5.42
SHROOM4Q9ULL8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC48.93■■■■■ 5.42
SHROOM4Q9ULL8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC48.93■■■■■ 5.42
SHROOM4Q9ULL8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.92■■■■■ 5.42
SHROOM4Q9ULL8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.92■■■■■ 5.42
SHROOM4Q9ULL8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.92■■■■■ 5.42
SHROOM4Q9ULL8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC48.9■■■■■ 5.42
SHROOM4Q9ULL8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC48.9■■■■■ 5.42
SHROOM4Q9ULL8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.89■■■■■ 5.42
SHROOM4Q9ULL8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC48.87■■■■■ 5.41
SHROOM4Q9ULL8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
SHROOM4Q9ULL8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC48.84■■■■■ 5.41
SHROOM4Q9ULL8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.84■■■■■ 5.41
SHROOM4Q9ULL8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
SHROOM4Q9ULL8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.83■■■■■ 5.41
SHROOM4Q9ULL8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC48.83■■■■■ 5.41
SHROOM4Q9ULL8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC48.82■■■■■ 5.41
SHROOM4Q9ULL8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
SHROOM4Q9ULL8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC48.81■■■■■ 5.4
SHROOM4Q9ULL8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
SHROOM4Q9ULL8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.81■■■■■ 5.4
SHROOM4Q9ULL8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.8■■■■■ 5.4
SHROOM4Q9ULL8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.8■■■■■ 5.4
SHROOM4Q9ULL8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.8■■■■■ 5.4
SHROOM4Q9ULL8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.79■■■■■ 5.4
SHROOM4Q9ULL8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC48.77■■■■■ 5.4
SHROOM4Q9ULL8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC48.76■■■■■ 5.4
SHROOM4Q9ULL8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.75■■■■■ 5.39
SHROOM4Q9ULL8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC48.75■■■■■ 5.39
SHROOM4Q9ULL8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC48.74■■■■■ 5.39
SHROOM4Q9ULL8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC48.74■■■■■ 5.39
SHROOM4Q9ULL8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC48.74■■■■■ 5.39
SHROOM4Q9ULL8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC48.74■■■■■ 5.39
SHROOM4Q9ULL8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC48.74■■■■■ 5.39
SHROOM4Q9ULL8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC48.72■■■■■ 5.39
SHROOM4Q9ULL8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
SHROOM4Q9ULL8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.72■■■■■ 5.39
SHROOM4Q9ULL8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.72■■■■■ 5.39
SHROOM4Q9ULL8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.71■■■■■ 5.39
SHROOM4Q9ULL8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.71■■■■■ 5.39
SHROOM4Q9ULL8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
SHROOM4Q9ULL8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC48.7■■■■■ 5.39
SHROOM4Q9ULL8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.7■■■■■ 5.39
SHROOM4Q9ULL8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
SHROOM4Q9ULL8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
SHROOM4Q9ULL8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.68■■■■■ 5.38
SHROOM4Q9ULL8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC48.67■■■■■ 5.38
SHROOM4Q9ULL8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC48.66■■■■■ 5.38
SHROOM4Q9ULL8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC48.66■■■■■ 5.38
SHROOM4Q9ULL8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
SHROOM4Q9ULL8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC48.65■■■■■ 5.38
SHROOM4Q9ULL8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
SHROOM4Q9ULL8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC48.65■■■■■ 5.38
SHROOM4Q9ULL8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.65■■■■■ 5.38
SHROOM4Q9ULL8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC48.65■■■■■ 5.38
SHROOM4Q9ULL8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.64■■■■■ 5.38
SHROOM4Q9ULL8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.64■■■■■ 5.38
SHROOM4Q9ULL8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.38
SHROOM4Q9ULL8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.63■■■■■ 5.37
SHROOM4Q9ULL8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
SHROOM4Q9ULL8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.62■■■■■ 5.37
SHROOM4Q9ULL8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.61■■■■■ 5.37
SHROOM4Q9ULL8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
SHROOM4Q9ULL8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
SHROOM4Q9ULL8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC48.59■■■■■ 5.37
SHROOM4Q9ULL8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC48.58■■■■■ 5.37
SHROOM4Q9ULL8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.58■■■■■ 5.37
SHROOM4Q9ULL8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
SHROOM4Q9ULL8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
SHROOM4Q9ULL8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
SHROOM4Q9ULL8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
SHROOM4Q9ULL8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC48.56■■■■■ 5.36
SHROOM4Q9ULL8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC48.55■■■■■ 5.36
SHROOM4Q9ULL8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
SHROOM4Q9ULL8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
SHROOM4Q9ULL8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.53■■■■■ 5.36
SHROOM4Q9ULL8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC48.53■■■■■ 5.36
SHROOM4Q9ULL8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.52■■■■■ 5.36
SHROOM4Q9ULL8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC48.52■■■■■ 5.36
SHROOM4Q9ULL8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC48.51■■■■■ 5.36
SHROOM4Q9ULL8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC48.51■■■■■ 5.36
SHROOM4Q9ULL8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC48.51■■■■■ 5.36
SHROOM4Q9ULL8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.51■■■■■ 5.36
SHROOM4Q9ULL8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.51■■■■■ 5.36
SHROOM4Q9ULL8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC48.5■■■■■ 5.36
SHROOM4Q9ULL8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.35
SHROOM4Q9ULL8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC48.5■■■■■ 5.35
SHROOM4Q9ULL8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC48.5■■■■■ 5.35
SHROOM4Q9ULL8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.35
SHROOM4Q9ULL8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC48.49■■■■■ 5.35
SHROOM4Q9ULL8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
SHROOM4Q9ULL8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC48.48■■■■■ 5.35
SHROOM4Q9ULL8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC48.47■■■■■ 5.35
SHROOM4Q9ULL8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
SHROOM4Q9ULL8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
SHROOM4Q9ULL8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC48.46■■■■■ 5.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms