Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PLXNB3Q9ULL4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PLXNB3Q9ULL4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PLXNB3Q9ULL4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLXNB3Q9ULL4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms