Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC2LQ9UL33 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC2LQ9UL33 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC2LQ9UL33 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC2LQ9UL33 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC2LQ9UL33 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC2LQ9UL33 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRAPPC2LQ9UL33 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC2LQ9UL33 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC2LQ9UL33 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC2LQ9UL33 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC2LQ9UL33 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC2LQ9UL33 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC2LQ9UL33 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC2LQ9UL33 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC2LQ9UL33 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC2LQ9UL33 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC2LQ9UL33 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC2LQ9UL33 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms