Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SARDHQ9UL12 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SARDHQ9UL12 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SARDHQ9UL12 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SARDHQ9UL12 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms