Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX7

NUP50, Nuclear pore complex protein Nup50, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50Q9UKX7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUP50Q9UKX7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NUP50Q9UKX7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NUP50Q9UKX7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NUP50Q9UKX7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms