Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERG28Q9UKR5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERG28Q9UKR5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERG28Q9UKR5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERG28Q9UKR5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERG28Q9UKR5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERG28Q9UKR5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERG28Q9UKR5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERG28Q9UKR5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERG28Q9UKR5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERG28Q9UKR5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERG28Q9UKR5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERG28Q9UKR5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERG28Q9UKR5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERG28Q9UKR5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERG28Q9UKR5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERG28Q9UKR5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ERG28Q9UKR5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERG28Q9UKR5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERG28Q9UKR5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms