Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
PARP4Q9UKK3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PARP4Q9UKK3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PARP4Q9UKK3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PARP4Q9UKK3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PARP4Q9UKK3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PARP4Q9UKK3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PARP4Q9UKK3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PARP4Q9UKK3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PARP4Q9UKK3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PARP4Q9UKK3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PARP4Q9UKK3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PARP4Q9UKK3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PARP4Q9UKK3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PARP4Q9UKK3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PARP4Q9UKK3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PARP4Q9UKK3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
PARP4Q9UKK3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PARP4Q9UKK3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PARP4Q9UKK3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PARP4Q9UKK3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PARP4Q9UKK3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PARP4Q9UKK3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PARP4Q9UKK3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PARP4Q9UKK3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PARP4Q9UKK3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PARP4Q9UKK3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PARP4Q9UKK3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PARP4Q9UKK3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PARP4Q9UKK3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PARP4Q9UKK3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
PARP4Q9UKK3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PARP4Q9UKK3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PARP4Q9UKK3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PARP4Q9UKK3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PARP4Q9UKK3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PARP4Q9UKK3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PARP4Q9UKK3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PARP4Q9UKK3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PARP4Q9UKK3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PARP4Q9UKK3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PARP4Q9UKK3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PARP4Q9UKK3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PARP4Q9UKK3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PARP4Q9UKK3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PARP4Q9UKK3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PARP4Q9UKK3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PARP4Q9UKK3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PARP4Q9UKK3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
PARP4Q9UKK3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PARP4Q9UKK3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PARP4Q9UKK3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PARP4Q9UKK3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PARP4Q9UKK3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PARP4Q9UKK3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PARP4Q9UKK3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PARP4Q9UKK3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PARP4Q9UKK3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PARP4Q9UKK3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PARP4Q9UKK3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PARP4Q9UKK3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PARP4Q9UKK3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PARP4Q9UKK3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PARP4Q9UKK3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PARP4Q9UKK3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PARP4Q9UKK3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PARP4Q9UKK3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PARP4Q9UKK3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PARP4Q9UKK3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PARP4Q9UKK3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PARP4Q9UKK3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PARP4Q9UKK3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PARP4Q9UKK3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PARP4Q9UKK3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PARP4Q9UKK3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PARP4Q9UKK3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PARP4Q9UKK3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PARP4Q9UKK3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PARP4Q9UKK3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PARP4Q9UKK3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PARP4Q9UKK3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PARP4Q9UKK3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PARP4Q9UKK3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
PARP4Q9UKK3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
PARP4Q9UKK3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
PARP4Q9UKK3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PARP4Q9UKK3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PARP4Q9UKK3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
PARP4Q9UKK3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
PARP4Q9UKK3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.81■■■■□ 3
PARP4Q9UKK3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PARP4Q9UKK3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PARP4Q9UKK3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PARP4Q9UKK3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.78■■■■□ 3
PARP4Q9UKK3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PARP4Q9UKK3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PARP4Q9UKK3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PARP4Q9UKK3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
PARP4Q9UKK3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PARP4Q9UKK3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms