Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCP2D1Q9UJQ7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SCP2D1Q9UJQ7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCP2D1Q9UJQ7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCP2D1Q9UJQ7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCP2D1Q9UJQ7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCP2D1Q9UJQ7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCP2D1Q9UJQ7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCP2D1Q9UJQ7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SCP2D1Q9UJQ7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCP2D1Q9UJQ7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCP2D1Q9UJQ7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCP2D1Q9UJQ7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCP2D1Q9UJQ7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCP2D1Q9UJQ7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCP2D1Q9UJQ7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCP2D1Q9UJQ7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCP2D1Q9UJQ7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCP2D1Q9UJQ7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCP2D1Q9UJQ7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SCP2D1Q9UJQ7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCP2D1Q9UJQ7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SCP2D1Q9UJQ7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms