Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CTNNA3Q9UI47 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CTNNA3Q9UI47 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CTNNA3Q9UI47 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CTNNA3Q9UI47 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CTNNA3Q9UI47 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CTNNA3Q9UI47 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CTNNA3Q9UI47 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTNNA3Q9UI47 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTNNA3Q9UI47 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTNNA3Q9UI47 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CTNNA3Q9UI47 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CTNNA3Q9UI47 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
CTNNA3Q9UI47 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CTNNA3Q9UI47 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CTNNA3Q9UI47 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CTNNA3Q9UI47 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CTNNA3Q9UI47 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CTNNA3Q9UI47 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CTNNA3Q9UI47 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CTNNA3Q9UI47 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CTNNA3Q9UI47 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CTNNA3Q9UI47 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CTNNA3Q9UI47 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CTNNA3Q9UI47 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CTNNA3Q9UI47 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CTNNA3Q9UI47 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CTNNA3Q9UI47 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CTNNA3Q9UI47 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CTNNA3Q9UI47 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTNNA3Q9UI47 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTNNA3Q9UI47 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CTNNA3Q9UI47 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CTNNA3Q9UI47 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CTNNA3Q9UI47 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CTNNA3Q9UI47 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
CTNNA3Q9UI47 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms