Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEPT3Q9UH03 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEPT3Q9UH03 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEPT3Q9UH03 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEPT3Q9UH03 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEPT3Q9UH03 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEPT3Q9UH03 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEPT3Q9UH03 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEPT3Q9UH03 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEPT3Q9UH03 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEPT3Q9UH03 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEPT3Q9UH03 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEPT3Q9UH03 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEPT3Q9UH03 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SEPT3Q9UH03 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEPT3Q9UH03 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEPT3Q9UH03 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEPT3Q9UH03 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEPT3Q9UH03 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEPT3Q9UH03 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEPT3Q9UH03 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEPT3Q9UH03 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEPT3Q9UH03 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEPT3Q9UH03 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEPT3Q9UH03 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEPT3Q9UH03 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEPT3Q9UH03 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEPT3Q9UH03 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEPT3Q9UH03 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEPT3Q9UH03 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEPT3Q9UH03 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEPT3Q9UH03 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEPT3Q9UH03 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEPT3Q9UH03 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEPT3Q9UH03 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEPT3Q9UH03 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SEPT3Q9UH03 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEPT3Q9UH03 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEPT3Q9UH03 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEPT3Q9UH03 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEPT3Q9UH03 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEPT3Q9UH03 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEPT3Q9UH03 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms