Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCF20Q9UGU0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCF20Q9UGU0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TCF20Q9UGU0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCF20Q9UGU0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCF20Q9UGU0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCF20Q9UGU0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCF20Q9UGU0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCF20Q9UGU0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TCF20Q9UGU0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCF20Q9UGU0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCF20Q9UGU0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCF20Q9UGU0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCF20Q9UGU0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCF20Q9UGU0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCF20Q9UGU0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCF20Q9UGU0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCF20Q9UGU0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCF20Q9UGU0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TCF20Q9UGU0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCF20Q9UGU0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCF20Q9UGU0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TCF20Q9UGU0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCF20Q9UGU0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCF20Q9UGU0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCF20Q9UGU0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCF20Q9UGU0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCF20Q9UGU0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCF20Q9UGU0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCF20Q9UGU0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCF20Q9UGU0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCF20Q9UGU0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCF20Q9UGU0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCF20Q9UGU0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCF20Q9UGU0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCF20Q9UGU0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCF20Q9UGU0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCF20Q9UGU0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCF20Q9UGU0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCF20Q9UGU0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCF20Q9UGU0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TCF20Q9UGU0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCF20Q9UGU0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCF20Q9UGU0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TCF20Q9UGU0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCF20Q9UGU0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCF20Q9UGU0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
TCF20Q9UGU0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCF20Q9UGU0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms