Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX1-2Q9UD57 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX1-2Q9UD57 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX1-2Q9UD57 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-2Q9UD57 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-2Q9UD57 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-2Q9UD57 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-2Q9UD57 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-2Q9UD57 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-2Q9UD57 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-2Q9UD57 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX1-2Q9UD57 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKX1-2Q9UD57 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-2Q9UD57 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-2Q9UD57 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKX1-2Q9UD57 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX1-2Q9UD57 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX1-2Q9UD57 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX1-2Q9UD57 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX1-2Q9UD57 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NKX1-2Q9UD57 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NKX1-2Q9UD57 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NKX1-2Q9UD57 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NKX1-2Q9UD57 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NKX1-2Q9UD57 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms