Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Psmb3Q9R1P1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmb3Q9R1P1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Psmb3Q9R1P1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb3Q9R1P1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Psmb3Q9R1P1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb3Q9R1P1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb3Q9R1P1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb3Q9R1P1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb3Q9R1P1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psmb3Q9R1P1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb3Q9R1P1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb3Q9R1P1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psmb3Q9R1P1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb3Q9R1P1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb3Q9R1P1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb3Q9R1P1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psmb3Q9R1P1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb3Q9R1P1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb3Q9R1P1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb3Q9R1P1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb3Q9R1P1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb3Q9R1P1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb3Q9R1P1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psmb3Q9R1P1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb3Q9R1P1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psmb3Q9R1P1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb3Q9R1P1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb3Q9R1P1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb3Q9R1P1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psmb3Q9R1P1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psmb3Q9R1P1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb3Q9R1P1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb3Q9R1P1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psmb3Q9R1P1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb3Q9R1P1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb3Q9R1P1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb3Q9R1P1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psmb3Q9R1P1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb3Q9R1P1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb3Q9R1P1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb3Q9R1P1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb3Q9R1P1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Psmb3Q9R1P1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psmb3Q9R1P1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psmb3Q9R1P1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb3Q9R1P1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Psmb3Q9R1P1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms