Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psma4Q9R1P0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Psma4Q9R1P0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Psma4Q9R1P0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psma4Q9R1P0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psma4Q9R1P0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Psma4Q9R1P0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Psma4Q9R1P0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Psma4Q9R1P0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Psma4Q9R1P0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psma4Q9R1P0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psma4Q9R1P0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psma4Q9R1P0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Psma4Q9R1P0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psma4Q9R1P0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psma4Q9R1P0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Psma4Q9R1P0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psma4Q9R1P0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psma4Q9R1P0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Psma4Q9R1P0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psma4Q9R1P0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psma4Q9R1P0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psma4Q9R1P0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psma4Q9R1P0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Psma4Q9R1P0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Psma4Q9R1P0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Psma4Q9R1P0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Psma4Q9R1P0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psma4Q9R1P0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psma4Q9R1P0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Psma4Q9R1P0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psma4Q9R1P0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psma4Q9R1P0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psma4Q9R1P0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Psma4Q9R1P0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psma4Q9R1P0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psma4Q9R1P0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Psma4Q9R1P0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psma4Q9R1P0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Psma4Q9R1P0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Psma4Q9R1P0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.3 ms