Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcm1Q9R0L6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcm1Q9R0L6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcm1Q9R0L6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcm1Q9R0L6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcm1Q9R0L6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcm1Q9R0L6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcm1Q9R0L6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcm1Q9R0L6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcm1Q9R0L6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcm1Q9R0L6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcm1Q9R0L6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcm1Q9R0L6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcm1Q9R0L6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcm1Q9R0L6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcm1Q9R0L6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcm1Q9R0L6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcm1Q9R0L6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcm1Q9R0L6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcm1Q9R0L6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcm1Q9R0L6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcm1Q9R0L6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcm1Q9R0L6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcm1Q9R0L6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pcm1Q9R0L6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Pcm1Q9R0L6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Pcm1Q9R0L6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcm1Q9R0L6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcm1Q9R0L6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcm1Q9R0L6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcm1Q9R0L6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcm1Q9R0L6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcm1Q9R0L6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pcm1Q9R0L6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcm1Q9R0L6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcm1Q9R0L6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcm1Q9R0L6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcm1Q9R0L6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcm1Q9R0L6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcm1Q9R0L6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcm1Q9R0L6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcm1Q9R0L6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcm1Q9R0L6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcm1Q9R0L6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcm1Q9R0L6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcm1Q9R0L6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcm1Q9R0L6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcm1Q9R0L6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcm1Q9R0L6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcm1Q9R0L6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcm1Q9R0L6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcm1Q9R0L6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcm1Q9R0L6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcm1Q9R0L6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcm1Q9R0L6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcm1Q9R0L6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcm1Q9R0L6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcm1Q9R0L6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcm1Q9R0L6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcm1Q9R0L6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcm1Q9R0L6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcm1Q9R0L6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pcm1Q9R0L6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcm1Q9R0L6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcm1Q9R0L6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcm1Q9R0L6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcm1Q9R0L6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcm1Q9R0L6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcm1Q9R0L6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcm1Q9R0L6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcm1Q9R0L6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcm1Q9R0L6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcm1Q9R0L6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcm1Q9R0L6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcm1Q9R0L6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcm1Q9R0L6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcm1Q9R0L6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcm1Q9R0L6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcm1Q9R0L6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcm1Q9R0L6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcm1Q9R0L6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcm1Q9R0L6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcm1Q9R0L6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcm1Q9R0L6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcm1Q9R0L6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcm1Q9R0L6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcm1Q9R0L6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcm1Q9R0L6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcm1Q9R0L6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcm1Q9R0L6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcm1Q9R0L6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcm1Q9R0L6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcm1Q9R0L6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcm1Q9R0L6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcm1Q9R0L6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcm1Q9R0L6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms