Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
NrkQ9R0G8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
NrkQ9R0G8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NrkQ9R0G8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
NrkQ9R0G8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NrkQ9R0G8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NrkQ9R0G8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
NrkQ9R0G8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
NrkQ9R0G8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
NrkQ9R0G8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
NrkQ9R0G8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NrkQ9R0G8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NrkQ9R0G8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NrkQ9R0G8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NrkQ9R0G8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NrkQ9R0G8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
NrkQ9R0G8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NrkQ9R0G8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NrkQ9R0G8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NrkQ9R0G8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
NrkQ9R0G8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NrkQ9R0G8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NrkQ9R0G8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NrkQ9R0G8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NrkQ9R0G8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NrkQ9R0G8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NrkQ9R0G8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
NrkQ9R0G8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
NrkQ9R0G8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
NrkQ9R0G8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
NrkQ9R0G8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
NrkQ9R0G8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
NrkQ9R0G8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
NrkQ9R0G8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NrkQ9R0G8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NrkQ9R0G8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NrkQ9R0G8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
NrkQ9R0G8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
NrkQ9R0G8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
NrkQ9R0G8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
NrkQ9R0G8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NrkQ9R0G8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
NrkQ9R0G8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
NrkQ9R0G8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
NrkQ9R0G8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
NrkQ9R0G8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
NrkQ9R0G8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NrkQ9R0G8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NrkQ9R0G8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
NrkQ9R0G8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NrkQ9R0G8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NrkQ9R0G8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
NrkQ9R0G8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.72
NrkQ9R0G8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
NrkQ9R0G8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
NrkQ9R0G8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
NrkQ9R0G8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
NrkQ9R0G8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
NrkQ9R0G8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
NrkQ9R0G8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NrkQ9R0G8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
NrkQ9R0G8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
NrkQ9R0G8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
NrkQ9R0G8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
NrkQ9R0G8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
NrkQ9R0G8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
NrkQ9R0G8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NrkQ9R0G8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NrkQ9R0G8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NrkQ9R0G8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NrkQ9R0G8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NrkQ9R0G8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NrkQ9R0G8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NrkQ9R0G8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
NrkQ9R0G8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
NrkQ9R0G8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NrkQ9R0G8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC38.13■■■■□ 3.69
NrkQ9R0G8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
NrkQ9R0G8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
NrkQ9R0G8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
NrkQ9R0G8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NrkQ9R0G8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
NrkQ9R0G8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NrkQ9R0G8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NrkQ9R0G8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NrkQ9R0G8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NrkQ9R0G8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
NrkQ9R0G8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
NrkQ9R0G8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NrkQ9R0G8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NrkQ9R0G8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NrkQ9R0G8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NrkQ9R0G8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NrkQ9R0G8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NrkQ9R0G8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NrkQ9R0G8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NrkQ9R0G8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NrkQ9R0G8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
NrkQ9R0G8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NrkQ9R0G8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms