Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nek3Q9R0A5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nek3Q9R0A5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nek3Q9R0A5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nek3Q9R0A5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nek3Q9R0A5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nek3Q9R0A5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nek3Q9R0A5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nek3Q9R0A5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nek3Q9R0A5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nek3Q9R0A5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nek3Q9R0A5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nek3Q9R0A5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nek3Q9R0A5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nek3Q9R0A5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nek3Q9R0A5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nek3Q9R0A5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nek3Q9R0A5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nek3Q9R0A5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nek3Q9R0A5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nek3Q9R0A5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nek3Q9R0A5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nek3Q9R0A5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nek3Q9R0A5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nek3Q9R0A5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nek3Q9R0A5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nek3Q9R0A5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nek3Q9R0A5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nek3Q9R0A5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nek3Q9R0A5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nek3Q9R0A5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nek3Q9R0A5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nek3Q9R0A5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nek3Q9R0A5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nek3Q9R0A5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nek3Q9R0A5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Nek3Q9R0A5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nek3Q9R0A5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nek3Q9R0A5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nek3Q9R0A5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nek3Q9R0A5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nek3Q9R0A5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nek3Q9R0A5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nek3Q9R0A5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nek3Q9R0A5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nek3Q9R0A5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nek3Q9R0A5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nek3Q9R0A5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nek3Q9R0A5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Nek3Q9R0A5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nek3Q9R0A5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nek3Q9R0A5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nek3Q9R0A5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nek3Q9R0A5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nek3Q9R0A5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nek3Q9R0A5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nek3Q9R0A5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nek3Q9R0A5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nek3Q9R0A5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nek3Q9R0A5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nek3Q9R0A5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nek3Q9R0A5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nek3Q9R0A5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nek3Q9R0A5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nek3Q9R0A5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nek3Q9R0A5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nek3Q9R0A5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nek3Q9R0A5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nek3Q9R0A5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nek3Q9R0A5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nek3Q9R0A5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nek3Q9R0A5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nek3Q9R0A5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nek3Q9R0A5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nek3Q9R0A5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nek3Q9R0A5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek3Q9R0A5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek3Q9R0A5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek3Q9R0A5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek3Q9R0A5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nek3Q9R0A5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nek3Q9R0A5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek3Q9R0A5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek3Q9R0A5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek3Q9R0A5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek3Q9R0A5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek3Q9R0A5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek3Q9R0A5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek3Q9R0A5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek3Q9R0A5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek3Q9R0A5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek3Q9R0A5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek3Q9R0A5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek3Q9R0A5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek3Q9R0A5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek3Q9R0A5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek3Q9R0A5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek3Q9R0A5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek3Q9R0A5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek3Q9R0A5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms