Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col4a3Q9QZS0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Col4a3Q9QZS0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col4a3Q9QZS0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col4a3Q9QZS0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Col4a3Q9QZS0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col4a3Q9QZS0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col4a3Q9QZS0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col4a3Q9QZS0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col4a3Q9QZS0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col4a3Q9QZS0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Col4a3Q9QZS0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col4a3Q9QZS0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Col4a3Q9QZS0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Col4a3Q9QZS0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col4a3Q9QZS0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col4a3Q9QZS0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col4a3Q9QZS0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col4a3Q9QZS0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Col4a3Q9QZS0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a3Q9QZS0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a3Q9QZS0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Col4a3Q9QZS0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Col4a3Q9QZS0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Col4a3Q9QZS0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a3Q9QZS0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Col4a3Q9QZS0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col4a3Q9QZS0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Col4a3Q9QZS0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Col4a3Q9QZS0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col4a3Q9QZS0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Col4a3Q9QZS0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col4a3Q9QZS0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Col4a3Q9QZS0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Col4a3Q9QZS0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col4a3Q9QZS0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col4a3Q9QZS0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col4a3Q9QZS0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Col4a3Q9QZS0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Col4a3Q9QZS0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col4a3Q9QZS0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col4a3Q9QZS0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Col4a3Q9QZS0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Col4a3Q9QZS0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col4a3Q9QZS0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col4a3Q9QZS0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col4a3Q9QZS0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Col4a3Q9QZS0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col4a3Q9QZS0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col4a3Q9QZS0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a3Q9QZS0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col4a3Q9QZS0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
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