Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a4Q9QZR9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a4Q9QZR9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a4Q9QZR9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col4a4Q9QZR9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a4Q9QZR9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col4a4Q9QZR9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a4Q9QZR9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a4Q9QZR9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a4Q9QZR9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a4Q9QZR9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col4a4Q9QZR9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a4Q9QZR9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a4Q9QZR9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a4Q9QZR9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col4a4Q9QZR9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a4Q9QZR9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col4a4Q9QZR9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a4Q9QZR9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a4Q9QZR9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a4Q9QZR9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col4a4Q9QZR9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col4a4Q9QZR9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col4a4Q9QZR9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a4Q9QZR9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Col4a4Q9QZR9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Col4a4Q9QZR9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col4a4Q9QZR9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col4a4Q9QZR9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Col4a4Q9QZR9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Col4a4Q9QZR9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Col4a4Q9QZR9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col4a4Q9QZR9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Col4a4Q9QZR9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col4a4Q9QZR9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Col4a4Q9QZR9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col4a4Q9QZR9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col4a4Q9QZR9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col4a4Q9QZR9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Col4a4Q9QZR9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a4Q9QZR9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a4Q9QZR9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a4Q9QZR9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Col4a4Q9QZR9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a4Q9QZR9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a4Q9QZR9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a4Q9QZR9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a4Q9QZR9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a4Q9QZR9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a4Q9QZR9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Col4a4Q9QZR9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col4a4Q9QZR9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a4Q9QZR9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a4Q9QZR9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col4a4Q9QZR9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col4a4Q9QZR9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col4a4Q9QZR9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col4a4Q9QZR9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a4Q9QZR9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a4Q9QZR9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a4Q9QZR9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a4Q9QZR9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Col4a4Q9QZR9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col4a4Q9QZR9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Col4a4Q9QZR9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col4a4Q9QZR9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col4a4Q9QZR9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Col4a4Q9QZR9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Col4a4Q9QZR9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Col4a4Q9QZR9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Col4a4Q9QZR9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms