Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ8

H2afy, Core histone macro-H2A.1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afyQ9QZQ8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2afyQ9QZQ8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
H2afyQ9QZQ8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
H2afyQ9QZQ8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2afyQ9QZQ8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2afyQ9QZQ8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
H2afyQ9QZQ8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
H2afyQ9QZQ8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afyQ9QZQ8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afyQ9QZQ8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afyQ9QZQ8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afyQ9QZQ8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
H2afyQ9QZQ8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2afyQ9QZQ8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2afyQ9QZQ8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2afyQ9QZQ8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2afyQ9QZQ8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2afyQ9QZQ8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2afyQ9QZQ8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
H2afyQ9QZQ8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2afyQ9QZQ8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2afyQ9QZQ8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
H2afyQ9QZQ8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2afyQ9QZQ8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2afyQ9QZQ8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2afyQ9QZQ8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
H2afyQ9QZQ8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2afyQ9QZQ8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2afyQ9QZQ8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2afyQ9QZQ8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2afyQ9QZQ8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
H2afyQ9QZQ8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2afyQ9QZQ8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2afyQ9QZQ8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2afyQ9QZQ8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2afyQ9QZQ8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2afyQ9QZQ8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2afyQ9QZQ8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2afyQ9QZQ8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2afyQ9QZQ8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2afyQ9QZQ8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2afyQ9QZQ8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2afyQ9QZQ8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2afyQ9QZQ8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2afyQ9QZQ8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2afyQ9QZQ8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2afyQ9QZQ8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H2afyQ9QZQ8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2afyQ9QZQ8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2afyQ9QZQ8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2afyQ9QZQ8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2afyQ9QZQ8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2afyQ9QZQ8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2afyQ9QZQ8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2afyQ9QZQ8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2afyQ9QZQ8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2afyQ9QZQ8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2afyQ9QZQ8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2afyQ9QZQ8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2afyQ9QZQ8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2afyQ9QZQ8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2afyQ9QZQ8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms