Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Tnnt3Q9QZ47 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Tnnt3Q9QZ47 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Tnnt3Q9QZ47 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Tnnt3Q9QZ47 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Tnnt3Q9QZ47 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Tnnt3Q9QZ47 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tnnt3Q9QZ47 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tnnt3Q9QZ47 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tnnt3Q9QZ47 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tnnt3Q9QZ47 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tnnt3Q9QZ47 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tnnt3Q9QZ47 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tnnt3Q9QZ47 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tnnt3Q9QZ47 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Tnnt3Q9QZ47 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Tnnt3Q9QZ47 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Tnnt3Q9QZ47 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Tnnt3Q9QZ47 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Tnnt3Q9QZ47 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Tnnt3Q9QZ47 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Tnnt3Q9QZ47 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Tnnt3Q9QZ47 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Tnnt3Q9QZ47 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Tnnt3Q9QZ47 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Tnnt3Q9QZ47 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Tnnt3Q9QZ47 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Tnnt3Q9QZ47 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Tnnt3Q9QZ47 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Tnnt3Q9QZ47 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Tnnt3Q9QZ47 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Tnnt3Q9QZ47 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Tnnt3Q9QZ47 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tnnt3Q9QZ47 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tnnt3Q9QZ47 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Tnnt3Q9QZ47 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Tnnt3Q9QZ47 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Tnnt3Q9QZ47 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Tnnt3Q9QZ47 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Tnnt3Q9QZ47 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Tnnt3Q9QZ47 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Tnnt3Q9QZ47 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Tnnt3Q9QZ47 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tnnt3Q9QZ47 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Tnnt3Q9QZ47 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tnnt3Q9QZ47 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Tnnt3Q9QZ47 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tnnt3Q9QZ47 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tnnt3Q9QZ47 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tnnt3Q9QZ47 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tnnt3Q9QZ47 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tnnt3Q9QZ47 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tnnt3Q9QZ47 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tnnt3Q9QZ47 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Tnnt3Q9QZ47 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Tnnt3Q9QZ47 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Tnnt3Q9QZ47 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tnnt3Q9QZ47 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tnnt3Q9QZ47 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tnnt3Q9QZ47 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tnnt3Q9QZ47 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tnnt3Q9QZ47 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tnnt3Q9QZ47 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tnnt3Q9QZ47 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tnnt3Q9QZ47 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tnnt3Q9QZ47 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tnnt3Q9QZ47 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tnnt3Q9QZ47 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tnnt3Q9QZ47 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Tnnt3Q9QZ47 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Tnnt3Q9QZ47 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Tnnt3Q9QZ47 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Tnnt3Q9QZ47 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tnnt3Q9QZ47 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tnnt3Q9QZ47 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tnnt3Q9QZ47 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tnnt3Q9QZ47 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Tnnt3Q9QZ47 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Tnnt3Q9QZ47 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Tnnt3Q9QZ47 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Tnnt3Q9QZ47 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Tnnt3Q9QZ47 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Tnnt3Q9QZ47 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Tnnt3Q9QZ47 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Tnnt3Q9QZ47 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Tnnt3Q9QZ47 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tnnt3Q9QZ47 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Tnnt3Q9QZ47 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tnnt3Q9QZ47 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tnnt3Q9QZ47 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Tnnt3Q9QZ47 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Tnnt3Q9QZ47 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Tnnt3Q9QZ47 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Tnnt3Q9QZ47 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Tnnt3Q9QZ47 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Tnnt3Q9QZ47 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Tnnt3Q9QZ47 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms