Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Six6Q9QZ28 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Six6Q9QZ28 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Six6Q9QZ28 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Six6Q9QZ28 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Six6Q9QZ28 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Six6Q9QZ28 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Six6Q9QZ28 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Six6Q9QZ28 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Six6Q9QZ28 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Six6Q9QZ28 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Six6Q9QZ28 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Six6Q9QZ28 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Six6Q9QZ28 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Six6Q9QZ28 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Six6Q9QZ28 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Six6Q9QZ28 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Six6Q9QZ28 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Six6Q9QZ28 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Six6Q9QZ28 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Six6Q9QZ28 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Six6Q9QZ28 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms