Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx4Q9QY61 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx4Q9QY61 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Irx4Q9QY61 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx4Q9QY61 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx4Q9QY61 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx4Q9QY61 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx4Q9QY61 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Irx4Q9QY61 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx4Q9QY61 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx4Q9QY61 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Irx4Q9QY61 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irx4Q9QY61 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Irx4Q9QY61 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Irx4Q9QY61 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Irx4Q9QY61 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Irx4Q9QY61 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irx4Q9QY61 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Irx4Q9QY61 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Irx4Q9QY61 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Irx4Q9QY61 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx4Q9QY61 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Irx4Q9QY61 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irx4Q9QY61 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Irx4Q9QY61 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms