Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Apbb1Q9QXJ1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Apbb1Q9QXJ1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Apbb1Q9QXJ1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Apbb1Q9QXJ1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Apbb1Q9QXJ1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Apbb1Q9QXJ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Apbb1Q9QXJ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Apbb1Q9QXJ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Apbb1Q9QXJ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Apbb1Q9QXJ1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Apbb1Q9QXJ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Apbb1Q9QXJ1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Apbb1Q9QXJ1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Apbb1Q9QXJ1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Apbb1Q9QXJ1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Apbb1Q9QXJ1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Apbb1Q9QXJ1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Apbb1Q9QXJ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Apbb1Q9QXJ1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Apbb1Q9QXJ1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Apbb1Q9QXJ1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Apbb1Q9QXJ1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Apbb1Q9QXJ1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Apbb1Q9QXJ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Apbb1Q9QXJ1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Apbb1Q9QXJ1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Apbb1Q9QXJ1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Apbb1Q9QXJ1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Apbb1Q9QXJ1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Apbb1Q9QXJ1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Apbb1Q9QXJ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Apbb1Q9QXJ1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Apbb1Q9QXJ1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Apbb1Q9QXJ1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Apbb1Q9QXJ1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Apbb1Q9QXJ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Apbb1Q9QXJ1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Apbb1Q9QXJ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Apbb1Q9QXJ1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Apbb1Q9QXJ1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Apbb1Q9QXJ1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Apbb1Q9QXJ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Apbb1Q9QXJ1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Apbb1Q9QXJ1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Apbb1Q9QXJ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Apbb1Q9QXJ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Apbb1Q9QXJ1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Apbb1Q9QXJ1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Apbb1Q9QXJ1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Apbb1Q9QXJ1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Apbb1Q9QXJ1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Apbb1Q9QXJ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Apbb1Q9QXJ1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Apbb1Q9QXJ1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Apbb1Q9QXJ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Apbb1Q9QXJ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Apbb1Q9QXJ1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Apbb1Q9QXJ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Apbb1Q9QXJ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Apbb1Q9QXJ1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Apbb1Q9QXJ1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Apbb1Q9QXJ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Apbb1Q9QXJ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Apbb1Q9QXJ1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Apbb1Q9QXJ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Apbb1Q9QXJ1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Apbb1Q9QXJ1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Apbb1Q9QXJ1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Apbb1Q9QXJ1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Apbb1Q9QXJ1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Apbb1Q9QXJ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Apbb1Q9QXJ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Apbb1Q9QXJ1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Apbb1Q9QXJ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Apbb1Q9QXJ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Apbb1Q9QXJ1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Apbb1Q9QXJ1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Apbb1Q9QXJ1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Apbb1Q9QXJ1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Apbb1Q9QXJ1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Apbb1Q9QXJ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Apbb1Q9QXJ1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Apbb1Q9QXJ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Apbb1Q9QXJ1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Apbb1Q9QXJ1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Apbb1Q9QXJ1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Apbb1Q9QXJ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Apbb1Q9QXJ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Apbb1Q9QXJ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Apbb1Q9QXJ1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Apbb1Q9QXJ1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Apbb1Q9QXJ1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Apbb1Q9QXJ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Apbb1Q9QXJ1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Apbb1Q9QXJ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Apbb1Q9QXJ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Apbb1Q9QXJ1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Apbb1Q9QXJ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Apbb1Q9QXJ1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms