Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt17Q9QWL7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt17Q9QWL7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt17Q9QWL7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt17Q9QWL7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt17Q9QWL7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt17Q9QWL7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt17Q9QWL7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt17Q9QWL7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt17Q9QWL7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt17Q9QWL7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt17Q9QWL7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt17Q9QWL7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt17Q9QWL7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt17Q9QWL7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt17Q9QWL7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt17Q9QWL7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt17Q9QWL7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt17Q9QWL7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt17Q9QWL7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt17Q9QWL7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt17Q9QWL7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt17Q9QWL7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt17Q9QWL7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt17Q9QWL7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt17Q9QWL7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt17Q9QWL7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt17Q9QWL7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt17Q9QWL7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt17Q9QWL7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt17Q9QWL7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt17Q9QWL7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt17Q9QWL7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt17Q9QWL7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt17Q9QWL7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt17Q9QWL7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt17Q9QWL7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt17Q9QWL7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt17Q9QWL7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt17Q9QWL7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt17Q9QWL7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt17Q9QWL7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt17Q9QWL7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt17Q9QWL7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt17Q9QWL7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt17Q9QWL7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt17Q9QWL7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt17Q9QWL7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt17Q9QWL7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt17Q9QWL7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt17Q9QWL7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt17Q9QWL7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt17Q9QWL7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt17Q9QWL7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt17Q9QWL7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt17Q9QWL7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt17Q9QWL7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt17Q9QWL7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt17Q9QWL7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt17Q9QWL7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt17Q9QWL7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt17Q9QWL7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt17Q9QWL7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt17Q9QWL7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt17Q9QWL7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt17Q9QWL7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt17Q9QWL7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt17Q9QWL7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt17Q9QWL7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt17Q9QWL7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt17Q9QWL7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt17Q9QWL7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt17Q9QWL7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt17Q9QWL7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt17Q9QWL7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt17Q9QWL7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt17Q9QWL7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt17Q9QWL7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt17Q9QWL7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt17Q9QWL7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Krt17Q9QWL7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt17Q9QWL7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt17Q9QWL7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt17Q9QWL7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt17Q9QWL7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt17Q9QWL7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt17Q9QWL7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt17Q9QWL7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt17Q9QWL7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt17Q9QWL7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt17Q9QWL7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt17Q9QWL7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt17Q9QWL7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt17Q9QWL7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt17Q9QWL7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt17Q9QWL7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt17Q9QWL7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt17Q9QWL7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt17Q9QWL7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Krt17Q9QWL7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms