Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS9

Reg3d, Reg III delta, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reg3dQ9QUS9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reg3dQ9QUS9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Reg3dQ9QUS9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reg3dQ9QUS9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Reg3dQ9QUS9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reg3dQ9QUS9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reg3dQ9QUS9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reg3dQ9QUS9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reg3dQ9QUS9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reg3dQ9QUS9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Reg3dQ9QUS9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Reg3dQ9QUS9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Reg3dQ9QUS9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Reg3dQ9QUS9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Reg3dQ9QUS9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reg3dQ9QUS9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reg3dQ9QUS9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Reg3dQ9QUS9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reg3dQ9QUS9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reg3dQ9QUS9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reg3dQ9QUS9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reg3dQ9QUS9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reg3dQ9QUS9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reg3dQ9QUS9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reg3dQ9QUS9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Reg3dQ9QUS9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reg3dQ9QUS9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reg3dQ9QUS9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reg3dQ9QUS9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Reg3dQ9QUS9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reg3dQ9QUS9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reg3dQ9QUS9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reg3dQ9QUS9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Reg3dQ9QUS9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms