Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTTNBP2NLQ9P2B4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTTNBP2NLQ9P2B4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTTNBP2NLQ9P2B4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTTNBP2NLQ9P2B4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTTNBP2NLQ9P2B4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CTTNBP2NLQ9P2B4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CTTNBP2NLQ9P2B4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTTNBP2NLQ9P2B4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTTNBP2NLQ9P2B4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTTNBP2NLQ9P2B4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CTTNBP2NLQ9P2B4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTTNBP2NLQ9P2B4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CTTNBP2NLQ9P2B4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CTTNBP2NLQ9P2B4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms