Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ABI3Q9P2A4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABI3Q9P2A4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABI3Q9P2A4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABI3Q9P2A4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ABI3Q9P2A4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABI3Q9P2A4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ABI3Q9P2A4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABI3Q9P2A4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ABI3Q9P2A4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABI3Q9P2A4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABI3Q9P2A4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ABI3Q9P2A4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABI3Q9P2A4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ABI3Q9P2A4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABI3Q9P2A4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ABI3Q9P2A4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABI3Q9P2A4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ABI3Q9P2A4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABI3Q9P2A4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABI3Q9P2A4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ABI3Q9P2A4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ABI3Q9P2A4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABI3Q9P2A4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABI3Q9P2A4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABI3Q9P2A4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ABI3Q9P2A4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABI3Q9P2A4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABI3Q9P2A4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABI3Q9P2A4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABI3Q9P2A4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABI3Q9P2A4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ABI3Q9P2A4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABI3Q9P2A4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ABI3Q9P2A4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABI3Q9P2A4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABI3Q9P2A4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABI3Q9P2A4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABI3Q9P2A4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABI3Q9P2A4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ABI3Q9P2A4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABI3Q9P2A4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABI3Q9P2A4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABI3Q9P2A4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABI3Q9P2A4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms