Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC88CQ9P219 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC88CQ9P219 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC88CQ9P219 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC88CQ9P219 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC88CQ9P219 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC88CQ9P219 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC88CQ9P219 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC88CQ9P219 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC88CQ9P219 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC88CQ9P219 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC88CQ9P219 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC88CQ9P219 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC88CQ9P219 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC88CQ9P219 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC88CQ9P219 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC88CQ9P219 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC88CQ9P219 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC88CQ9P219 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC88CQ9P219 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC88CQ9P219 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC88CQ9P219 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC88CQ9P219 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC88CQ9P219 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC88CQ9P219 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC88CQ9P219 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC88CQ9P219 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC88CQ9P219 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC88CQ9P219 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC88CQ9P219 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC88CQ9P219 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC88CQ9P219 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC88CQ9P219 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC88CQ9P219 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC88CQ9P219 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC88CQ9P219 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC88CQ9P219 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC88CQ9P219 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC88CQ9P219 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC88CQ9P219 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms