Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDP1Q9P0J1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDP1Q9P0J1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDP1Q9P0J1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDP1Q9P0J1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDP1Q9P0J1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDP1Q9P0J1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDP1Q9P0J1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDP1Q9P0J1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDP1Q9P0J1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDP1Q9P0J1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDP1Q9P0J1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDP1Q9P0J1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDP1Q9P0J1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDP1Q9P0J1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDP1Q9P0J1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDP1Q9P0J1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDP1Q9P0J1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDP1Q9P0J1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDP1Q9P0J1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDP1Q9P0J1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PDP1Q9P0J1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDP1Q9P0J1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDP1Q9P0J1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDP1Q9P0J1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDP1Q9P0J1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDP1Q9P0J1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDP1Q9P0J1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDP1Q9P0J1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDP1Q9P0J1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDP1Q9P0J1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDP1Q9P0J1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDP1Q9P0J1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDP1Q9P0J1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDP1Q9P0J1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDP1Q9P0J1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDP1Q9P0J1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDP1Q9P0J1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDP1Q9P0J1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDP1Q9P0J1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms