Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMCD1Q9NZU5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMCD1Q9NZU5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LMCD1Q9NZU5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LMCD1Q9NZU5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMCD1Q9NZU5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LMCD1Q9NZU5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LMCD1Q9NZU5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMCD1Q9NZU5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMCD1Q9NZU5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LMCD1Q9NZU5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LMCD1Q9NZU5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMCD1Q9NZU5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LMCD1Q9NZU5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMCD1Q9NZU5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LMCD1Q9NZU5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
LMCD1Q9NZU5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms