Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PODXL2Q9NZ53 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PODXL2Q9NZ53 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PODXL2Q9NZ53 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PODXL2Q9NZ53 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
PODXL2Q9NZ53 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PODXL2Q9NZ53 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PODXL2Q9NZ53 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PODXL2Q9NZ53 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PODXL2Q9NZ53 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PODXL2Q9NZ53 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PODXL2Q9NZ53 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PODXL2Q9NZ53 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PODXL2Q9NZ53 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PODXL2Q9NZ53 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PODXL2Q9NZ53 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PODXL2Q9NZ53 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PODXL2Q9NZ53 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PODXL2Q9NZ53 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PODXL2Q9NZ53 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PODXL2Q9NZ53 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PODXL2Q9NZ53 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PODXL2Q9NZ53 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PODXL2Q9NZ53 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PODXL2Q9NZ53 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PODXL2Q9NZ53 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PODXL2Q9NZ53 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PODXL2Q9NZ53 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PODXL2Q9NZ53 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
PODXL2Q9NZ53 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PODXL2Q9NZ53 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PODXL2Q9NZ53 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PODXL2Q9NZ53 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PODXL2Q9NZ53 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PODXL2Q9NZ53 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PODXL2Q9NZ53 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PODXL2Q9NZ53 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PODXL2Q9NZ53 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PODXL2Q9NZ53 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PODXL2Q9NZ53 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PODXL2Q9NZ53 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PODXL2Q9NZ53 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PODXL2Q9NZ53 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PODXL2Q9NZ53 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PODXL2Q9NZ53 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PODXL2Q9NZ53 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PODXL2Q9NZ53 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PODXL2Q9NZ53 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PODXL2Q9NZ53 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PODXL2Q9NZ53 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PODXL2Q9NZ53 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PODXL2Q9NZ53 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PODXL2Q9NZ53 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PODXL2Q9NZ53 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PODXL2Q9NZ53 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PODXL2Q9NZ53 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PODXL2Q9NZ53 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PODXL2Q9NZ53 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PODXL2Q9NZ53 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PODXL2Q9NZ53 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
PODXL2Q9NZ53 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PODXL2Q9NZ53 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PODXL2Q9NZ53 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PODXL2Q9NZ53 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
PODXL2Q9NZ53 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PODXL2Q9NZ53 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PODXL2Q9NZ53 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PODXL2Q9NZ53 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
PODXL2Q9NZ53 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PODXL2Q9NZ53 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PODXL2Q9NZ53 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
PODXL2Q9NZ53 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PODXL2Q9NZ53 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PODXL2Q9NZ53 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms