Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CDK12Q9NYV4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CDK12Q9NYV4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CDK12Q9NYV4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CDK12Q9NYV4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
CDK12Q9NYV4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CDK12Q9NYV4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CDK12Q9NYV4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
CDK12Q9NYV4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CDK12Q9NYV4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CDK12Q9NYV4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CDK12Q9NYV4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CDK12Q9NYV4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CDK12Q9NYV4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CDK12Q9NYV4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CDK12Q9NYV4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CDK12Q9NYV4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CDK12Q9NYV4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CDK12Q9NYV4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CDK12Q9NYV4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CDK12Q9NYV4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CDK12Q9NYV4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CDK12Q9NYV4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CDK12Q9NYV4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CDK12Q9NYV4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CDK12Q9NYV4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CDK12Q9NYV4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CDK12Q9NYV4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CDK12Q9NYV4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CDK12Q9NYV4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CDK12Q9NYV4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CDK12Q9NYV4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CDK12Q9NYV4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CDK12Q9NYV4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CDK12Q9NYV4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CDK12Q9NYV4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CDK12Q9NYV4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CDK12Q9NYV4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CDK12Q9NYV4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CDK12Q9NYV4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CDK12Q9NYV4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CDK12Q9NYV4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CDK12Q9NYV4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CDK12Q9NYV4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CDK12Q9NYV4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CDK12Q9NYV4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CDK12Q9NYV4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CDK12Q9NYV4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CDK12Q9NYV4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CDK12Q9NYV4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CDK12Q9NYV4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CDK12Q9NYV4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CDK12Q9NYV4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CDK12Q9NYV4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CDK12Q9NYV4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CDK12Q9NYV4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CDK12Q9NYV4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CDK12Q9NYV4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CDK12Q9NYV4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CDK12Q9NYV4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CDK12Q9NYV4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CDK12Q9NYV4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CDK12Q9NYV4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CDK12Q9NYV4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CDK12Q9NYV4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CDK12Q9NYV4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CDK12Q9NYV4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CDK12Q9NYV4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CDK12Q9NYV4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
CDK12Q9NYV4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CDK12Q9NYV4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CDK12Q9NYV4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CDK12Q9NYV4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CDK12Q9NYV4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms