Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DLL3Q9NYJ7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DLL3Q9NYJ7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DLL3Q9NYJ7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DLL3Q9NYJ7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DLL3Q9NYJ7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DLL3Q9NYJ7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DLL3Q9NYJ7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DLL3Q9NYJ7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DLL3Q9NYJ7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DLL3Q9NYJ7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DLL3Q9NYJ7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DLL3Q9NYJ7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DLL3Q9NYJ7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms