Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC5A4Q9NY91 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC5A4Q9NY91 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC5A4Q9NY91 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC5A4Q9NY91 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC5A4Q9NY91 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC5A4Q9NY91 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC5A4Q9NY91 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC5A4Q9NY91 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC5A4Q9NY91 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC5A4Q9NY91 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC5A4Q9NY91 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC5A4Q9NY91 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC5A4Q9NY91 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC5A4Q9NY91 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC5A4Q9NY91 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC5A4Q9NY91 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC5A4Q9NY91 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC5A4Q9NY91 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC5A4Q9NY91 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC5A4Q9NY91 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC5A4Q9NY91 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC5A4Q9NY91 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC5A4Q9NY91 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC5A4Q9NY91 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC5A4Q9NY91 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC5A4Q9NY91 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC5A4Q9NY91 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC5A4Q9NY91 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC5A4Q9NY91 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC5A4Q9NY91 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC5A4Q9NY91 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC5A4Q9NY91 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC5A4Q9NY91 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC5A4Q9NY91 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC5A4Q9NY91 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC5A4Q9NY91 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC5A4Q9NY91 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC5A4Q9NY91 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC5A4Q9NY91 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC5A4Q9NY91 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SLC5A4Q9NY91 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC5A4Q9NY91 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC5A4Q9NY91 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC5A4Q9NY91 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC5A4Q9NY91 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC5A4Q9NY91 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC5A4Q9NY91 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC5A4Q9NY91 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC5A4Q9NY91 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC5A4Q9NY91 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC5A4Q9NY91 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC5A4Q9NY91 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC5A4Q9NY91 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC5A4Q9NY91 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC5A4Q9NY91 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SLC5A4Q9NY91 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC5A4Q9NY91 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC5A4Q9NY91 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC5A4Q9NY91 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SLC5A4Q9NY91 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLC5A4Q9NY91 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLC5A4Q9NY91 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC5A4Q9NY91 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC5A4Q9NY91 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC5A4Q9NY91 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLC5A4Q9NY91 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC5A4Q9NY91 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLC5A4Q9NY91 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC5A4Q9NY91 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC5A4Q9NY91 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC5A4Q9NY91 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC5A4Q9NY91 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLC5A4Q9NY91 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC5A4Q9NY91 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC5A4Q9NY91 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC5A4Q9NY91 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms