Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX43Q9NXZ2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDX43Q9NXZ2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
DDX43Q9NXZ2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX43Q9NXZ2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX43Q9NXZ2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX43Q9NXZ2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DDX43Q9NXZ2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX43Q9NXZ2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DDX43Q9NXZ2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX43Q9NXZ2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DDX43Q9NXZ2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
DDX43Q9NXZ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DDX43Q9NXZ2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX43Q9NXZ2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DDX43Q9NXZ2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX43Q9NXZ2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DDX43Q9NXZ2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX43Q9NXZ2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX43Q9NXZ2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX43Q9NXZ2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX43Q9NXZ2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX43Q9NXZ2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX43Q9NXZ2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
DDX43Q9NXZ2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX43Q9NXZ2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms