Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RBM28Q9NW13 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RBM28Q9NW13 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RBM28Q9NW13 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RBM28Q9NW13 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RBM28Q9NW13 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RBM28Q9NW13 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RBM28Q9NW13 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RBM28Q9NW13 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RBM28Q9NW13 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RBM28Q9NW13 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RBM28Q9NW13 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RBM28Q9NW13 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RBM28Q9NW13 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RBM28Q9NW13 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RBM28Q9NW13 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RBM28Q9NW13 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RBM28Q9NW13 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RBM28Q9NW13 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RBM28Q9NW13 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RBM28Q9NW13 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RBM28Q9NW13 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RBM28Q9NW13 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RBM28Q9NW13 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RBM28Q9NW13 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RBM28Q9NW13 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RBM28Q9NW13 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RBM28Q9NW13 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RBM28Q9NW13 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RBM28Q9NW13 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RBM28Q9NW13 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RBM28Q9NW13 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RBM28Q9NW13 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RBM28Q9NW13 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RBM28Q9NW13 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
RBM28Q9NW13 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RBM28Q9NW13 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RBM28Q9NW13 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RBM28Q9NW13 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RBM28Q9NW13 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RBM28Q9NW13 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
RBM28Q9NW13 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RBM28Q9NW13 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBM28Q9NW13 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBM28Q9NW13 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBM28Q9NW13 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RBM28Q9NW13 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RBM28Q9NW13 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RBM28Q9NW13 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms