Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ABCF3Q9NUQ8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ABCF3Q9NUQ8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCF3Q9NUQ8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCF3Q9NUQ8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms