Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUL5

RYDEN, Repressor of yield of DENV protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYDENQ9NUL5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RYDENQ9NUL5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RYDENQ9NUL5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RYDENQ9NUL5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RYDENQ9NUL5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RYDENQ9NUL5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RYDENQ9NUL5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RYDENQ9NUL5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RYDENQ9NUL5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RYDENQ9NUL5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RYDENQ9NUL5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RYDENQ9NUL5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RYDENQ9NUL5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RYDENQ9NUL5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RYDENQ9NUL5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RYDENQ9NUL5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RYDENQ9NUL5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RYDENQ9NUL5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RYDENQ9NUL5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RYDENQ9NUL5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RYDENQ9NUL5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RYDENQ9NUL5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RYDENQ9NUL5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RYDENQ9NUL5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RYDENQ9NUL5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RYDENQ9NUL5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RYDENQ9NUL5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RYDENQ9NUL5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RYDENQ9NUL5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RYDENQ9NUL5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RYDENQ9NUL5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RYDENQ9NUL5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RYDENQ9NUL5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RYDENQ9NUL5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RYDENQ9NUL5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RYDENQ9NUL5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RYDENQ9NUL5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RYDENQ9NUL5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RYDENQ9NUL5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RYDENQ9NUL5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RYDENQ9NUL5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RYDENQ9NUL5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RYDENQ9NUL5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RYDENQ9NUL5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms