Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
PDS5BQ9NTI5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC44.82■■■■■ 4.77
PDS5BQ9NTI5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
PDS5BQ9NTI5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
PDS5BQ9NTI5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC44.82■■■■■ 4.76
PDS5BQ9NTI5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
PDS5BQ9NTI5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
PDS5BQ9NTI5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC44.81■■■■■ 4.76
PDS5BQ9NTI5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
PDS5BQ9NTI5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
PDS5BQ9NTI5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.8■■■■■ 4.76
PDS5BQ9NTI5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.79■■■■■ 4.76
PDS5BQ9NTI5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
PDS5BQ9NTI5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
PDS5BQ9NTI5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
PDS5BQ9NTI5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
PDS5BQ9NTI5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
PDS5BQ9NTI5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.76■■■■■ 4.76
PDS5BQ9NTI5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
PDS5BQ9NTI5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC44.75■■■■■ 4.76
PDS5BQ9NTI5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC44.75■■■■■ 4.76
PDS5BQ9NTI5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
PDS5BQ9NTI5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
PDS5BQ9NTI5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC44.75■■■■■ 4.75
PDS5BQ9NTI5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
PDS5BQ9NTI5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC44.74■■■■■ 4.75
PDS5BQ9NTI5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
PDS5BQ9NTI5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC44.74■■■■■ 4.75
PDS5BQ9NTI5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
PDS5BQ9NTI5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC44.73■■■■■ 4.75
PDS5BQ9NTI5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
PDS5BQ9NTI5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
PDS5BQ9NTI5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
PDS5BQ9NTI5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.75
PDS5BQ9NTI5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.75
PDS5BQ9NTI5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.74
PDS5BQ9NTI5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
PDS5BQ9NTI5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC44.68■■■■■ 4.74
PDS5BQ9NTI5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
PDS5BQ9NTI5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.67■■■■■ 4.74
PDS5BQ9NTI5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
PDS5BQ9NTI5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
PDS5BQ9NTI5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
PDS5BQ9NTI5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC44.65■■■■■ 4.74
PDS5BQ9NTI5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
PDS5BQ9NTI5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
PDS5BQ9NTI5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
PDS5BQ9NTI5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
PDS5BQ9NTI5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
PDS5BQ9NTI5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
PDS5BQ9NTI5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC44.63■■■■■ 4.73
PDS5BQ9NTI5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
PDS5BQ9NTI5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC44.62■■■■■ 4.73
PDS5BQ9NTI5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
PDS5BQ9NTI5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.61■■■■■ 4.73
PDS5BQ9NTI5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
PDS5BQ9NTI5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
PDS5BQ9NTI5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC44.6■■■■■ 4.73
PDS5BQ9NTI5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
PDS5BQ9NTI5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
PDS5BQ9NTI5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
PDS5BQ9NTI5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
PDS5BQ9NTI5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
PDS5BQ9NTI5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
PDS5BQ9NTI5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC44.57■■■■■ 4.73
PDS5BQ9NTI5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
PDS5BQ9NTI5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC44.56■■■■■ 4.72
PDS5BQ9NTI5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC44.56■■■■■ 4.72
PDS5BQ9NTI5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
PDS5BQ9NTI5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC44.54■■■■■ 4.72
PDS5BQ9NTI5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC44.54■■■■■ 4.72
PDS5BQ9NTI5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
PDS5BQ9NTI5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC44.53■■■■■ 4.72
PDS5BQ9NTI5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
PDS5BQ9NTI5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
PDS5BQ9NTI5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
PDS5BQ9NTI5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.52■■■■■ 4.72
PDS5BQ9NTI5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
PDS5BQ9NTI5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
PDS5BQ9NTI5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC44.5■■■■■ 4.71
PDS5BQ9NTI5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
PDS5BQ9NTI5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.5■■■■■ 4.71
PDS5BQ9NTI5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
PDS5BQ9NTI5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC44.5■■■■■ 4.71
PDS5BQ9NTI5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC44.5■■■■■ 4.71
PDS5BQ9NTI5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
PDS5BQ9NTI5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
PDS5BQ9NTI5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
PDS5BQ9NTI5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
PDS5BQ9NTI5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
PDS5BQ9NTI5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
PDS5BQ9NTI5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC44.49■■■■■ 4.71
PDS5BQ9NTI5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
PDS5BQ9NTI5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
PDS5BQ9NTI5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
PDS5BQ9NTI5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
PDS5BQ9NTI5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC44.47■■■■■ 4.71
PDS5BQ9NTI5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
PDS5BQ9NTI5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
PDS5BQ9NTI5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms