Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C19orf12Q9NSK7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C19orf12Q9NSK7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C19orf12Q9NSK7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C19orf12Q9NSK7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C19orf12Q9NSK7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C19orf12Q9NSK7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C19orf12Q9NSK7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
C19orf12Q9NSK7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
C19orf12Q9NSK7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C19orf12Q9NSK7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms