Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG9

AAAS, Aladin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AAASQ9NRG9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AAASQ9NRG9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AAASQ9NRG9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AAASQ9NRG9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AAASQ9NRG9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AAASQ9NRG9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AAASQ9NRG9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AAASQ9NRG9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AAASQ9NRG9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AAASQ9NRG9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
AAASQ9NRG9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AAASQ9NRG9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AAASQ9NRG9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AAASQ9NRG9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AAASQ9NRG9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AAASQ9NRG9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AAASQ9NRG9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AAASQ9NRG9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AAASQ9NRG9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
AAASQ9NRG9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AAASQ9NRG9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
AAASQ9NRG9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
AAASQ9NRG9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
AAASQ9NRG9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
AAASQ9NRG9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AAASQ9NRG9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
AAASQ9NRG9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AAASQ9NRG9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AAASQ9NRG9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AAASQ9NRG9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AAASQ9NRG9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AAASQ9NRG9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AAASQ9NRG9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AAASQ9NRG9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AAASQ9NRG9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AAASQ9NRG9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AAASQ9NRG9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AAASQ9NRG9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AAASQ9NRG9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AAASQ9NRG9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AAASQ9NRG9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AAASQ9NRG9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
AAASQ9NRG9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AAASQ9NRG9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AAASQ9NRG9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
AAASQ9NRG9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AAASQ9NRG9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
AAASQ9NRG9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AAASQ9NRG9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.55■■■□□ 2
AAASQ9NRG9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AAASQ9NRG9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AAASQ9NRG9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AAASQ9NRG9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
AAASQ9NRG9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AAASQ9NRG9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AAASQ9NRG9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
AAASQ9NRG9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
AAASQ9NRG9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
AAASQ9NRG9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.53■■■□□ 2
AAASQ9NRG9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AAASQ9NRG9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AAASQ9NRG9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AAASQ9NRG9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AAASQ9NRG9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.52■■■□□ 2
AAASQ9NRG9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AAASQ9NRG9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AAASQ9NRG9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AAASQ9NRG9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AAASQ9NRG9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AAASQ9NRG9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AAASQ9NRG9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AAASQ9NRG9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AAASQ9NRG9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AAASQ9NRG9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AAASQ9NRG9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AAASQ9NRG9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AAASQ9NRG9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms