Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
DUOX2Q9NRD8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
DUOX2Q9NRD8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
DUOX2Q9NRD8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
DUOX2Q9NRD8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
DUOX2Q9NRD8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
DUOX2Q9NRD8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
DUOX2Q9NRD8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
DUOX2Q9NRD8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
DUOX2Q9NRD8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
DUOX2Q9NRD8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
DUOX2Q9NRD8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
DUOX2Q9NRD8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
DUOX2Q9NRD8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
DUOX2Q9NRD8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
DUOX2Q9NRD8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
DUOX2Q9NRD8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
DUOX2Q9NRD8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
DUOX2Q9NRD8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
DUOX2Q9NRD8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC38.2■■■■□ 3.71
DUOX2Q9NRD8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
DUOX2Q9NRD8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
DUOX2Q9NRD8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
DUOX2Q9NRD8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
DUOX2Q9NRD8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
DUOX2Q9NRD8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
DUOX2Q9NRD8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
DUOX2Q9NRD8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
DUOX2Q9NRD8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
DUOX2Q9NRD8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
DUOX2Q9NRD8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
DUOX2Q9NRD8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
DUOX2Q9NRD8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
DUOX2Q9NRD8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
DUOX2Q9NRD8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
DUOX2Q9NRD8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.13■■■■□ 3.69
DUOX2Q9NRD8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
DUOX2Q9NRD8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
DUOX2Q9NRD8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
DUOX2Q9NRD8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
DUOX2Q9NRD8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
DUOX2Q9NRD8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
DUOX2Q9NRD8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
DUOX2Q9NRD8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
DUOX2Q9NRD8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
DUOX2Q9NRD8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
DUOX2Q9NRD8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
DUOX2Q9NRD8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
DUOX2Q9NRD8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
DUOX2Q9NRD8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
DUOX2Q9NRD8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
DUOX2Q9NRD8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
DUOX2Q9NRD8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
DUOX2Q9NRD8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
DUOX2Q9NRD8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
DUOX2Q9NRD8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
DUOX2Q9NRD8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC38.05■■■■□ 3.68
DUOX2Q9NRD8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
DUOX2Q9NRD8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
DUOX2Q9NRD8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
DUOX2Q9NRD8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
DUOX2Q9NRD8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
DUOX2Q9NRD8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
DUOX2Q9NRD8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
DUOX2Q9NRD8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38■■■■□ 3.67
DUOX2Q9NRD8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
DUOX2Q9NRD8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
DUOX2Q9NRD8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
DUOX2Q9NRD8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
DUOX2Q9NRD8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
DUOX2Q9NRD8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
DUOX2Q9NRD8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
DUOX2Q9NRD8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
DUOX2Q9NRD8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
DUOX2Q9NRD8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
DUOX2Q9NRD8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
DUOX2Q9NRD8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
DUOX2Q9NRD8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
DUOX2Q9NRD8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
DUOX2Q9NRD8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
DUOX2Q9NRD8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
DUOX2Q9NRD8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
DUOX2Q9NRD8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
DUOX2Q9NRD8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
DUOX2Q9NRD8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
DUOX2Q9NRD8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
DUOX2Q9NRD8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
DUOX2Q9NRD8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
DUOX2Q9NRD8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
DUOX2Q9NRD8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
DUOX2Q9NRD8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
DUOX2Q9NRD8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
DUOX2Q9NRD8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
DUOX2Q9NRD8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
DUOX2Q9NRD8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
DUOX2Q9NRD8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
DUOX2Q9NRD8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
DUOX2Q9NRD8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
DUOX2Q9NRD8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
DUOX2Q9NRD8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms