Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAR1AQ9NR31 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SAR1AQ9NR31 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAR1AQ9NR31 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAR1AQ9NR31 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAR1AQ9NR31 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAR1AQ9NR31 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SAR1AQ9NR31 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SAR1AQ9NR31 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAR1AQ9NR31 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SAR1AQ9NR31 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SAR1AQ9NR31 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SAR1AQ9NR31 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAR1AQ9NR31 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAR1AQ9NR31 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SAR1AQ9NR31 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SAR1AQ9NR31 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SAR1AQ9NR31 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SAR1AQ9NR31 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SAR1AQ9NR31 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms