Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CD163L1Q9NR16 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CD163L1Q9NR16 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CD163L1Q9NR16 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CD163L1Q9NR16 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CD163L1Q9NR16 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CD163L1Q9NR16 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
CD163L1Q9NR16 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CD163L1Q9NR16 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CD163L1Q9NR16 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CD163L1Q9NR16 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CD163L1Q9NR16 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CD163L1Q9NR16 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CD163L1Q9NR16 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CD163L1Q9NR16 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CD163L1Q9NR16 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CD163L1Q9NR16 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CD163L1Q9NR16 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CD163L1Q9NR16 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CD163L1Q9NR16 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CD163L1Q9NR16 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
CD163L1Q9NR16 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CD163L1Q9NR16 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CD163L1Q9NR16 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CD163L1Q9NR16 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CD163L1Q9NR16 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CD163L1Q9NR16 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CD163L1Q9NR16 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CD163L1Q9NR16 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CD163L1Q9NR16 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
CD163L1Q9NR16 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CD163L1Q9NR16 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CD163L1Q9NR16 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CD163L1Q9NR16 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CD163L1Q9NR16 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
CD163L1Q9NR16 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CD163L1Q9NR16 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CD163L1Q9NR16 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CD163L1Q9NR16 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CD163L1Q9NR16 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CD163L1Q9NR16 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CD163L1Q9NR16 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CD163L1Q9NR16 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CD163L1Q9NR16 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CD163L1Q9NR16 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CD163L1Q9NR16 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CD163L1Q9NR16 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CD163L1Q9NR16 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CD163L1Q9NR16 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CD163L1Q9NR16 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CD163L1Q9NR16 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CD163L1Q9NR16 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CD163L1Q9NR16 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CD163L1Q9NR16 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CD163L1Q9NR16 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CD163L1Q9NR16 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CD163L1Q9NR16 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CD163L1Q9NR16 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CD163L1Q9NR16 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CD163L1Q9NR16 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CD163L1Q9NR16 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
CD163L1Q9NR16 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CD163L1Q9NR16 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CD163L1Q9NR16 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CD163L1Q9NR16 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CD163L1Q9NR16 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CD163L1Q9NR16 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CD163L1Q9NR16 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CD163L1Q9NR16 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CD163L1Q9NR16 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CD163L1Q9NR16 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CD163L1Q9NR16 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CD163L1Q9NR16 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CD163L1Q9NR16 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CD163L1Q9NR16 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms